系統的藥師法門身心鍛煉法，我們可以把它分為以下幾個步驟：第一步，安住于因果身。所謂“安住于因果身”，就是要能夠深信因果，了知業果律和無我律。業果律是什么呢？出世間的業果律就是空性智慧，就是安住于因果身。

       當我們能夠不斷的身心變得越來越清靜，能夠越來越有精神的那種狀態。那些錯誤的見解和認識，遠離這些困擾的情緒，我們生命的能量就會越來越充沛，我們才能逐漸修行戒定慧這種修法。所以說安住于因果身是很重要的。

       第二步，也就是藥師法門當中一個特別方便的法門“針灸前行禪”，通過針灸前行禪去激發能量身的活力。當我們安住于因果身當中，來做這種針灸前行禪，從而開啟這種通過一層一層的能量身的鍛煉。

       第三步是做藥師瑜伽。包括十二論瑜伽、四無量清凈瑜伽、息瑜伽、天瑜伽等這些瑜伽得到的的多元瑜伽叫做藥師瑜伽。

       通過以上這幾步，都可以讓我們的能量身激活。那么第一步的安住于因果身目的是什么？實際上就是為了讓我們的身心能量不流失。佛法說內心的煩惱是有漏，使我們身上的能量不斷的漏失，我們的心不斷跟隨這些物我的外境，不斷的去追求、不斷的升起欲望、然后不斷的盲目去追逐這些物質的目標，我們的能量就會不斷的漏失，這樣的身心狀態就屬于一種有漏的狀態。第二、三步就是提升激活能量身。

       第四步就是修內觀禪，修藥師定，即打坐。打坐實際是綜合的身心修煉，不要看打坐是靜態的，其實不完全是靜態的。我們打坐的時候，表面上身體是不動的，實際上內在它是在不斷的運轉。打坐的時候，最重要的調身，實際上它也會越來越密切的調身，越來越有規律的觀照我們的心。動態當中禪修也是有的，比如精神上的禪修、吃飯當中的禪修等等。

       再比如說身體的放松，在日常的生活當中我們要時刻的去注意我們身體的那種緊張的狀態。當我們語速變快、或者和他人生起一些沖突的時候，此時我們要回到我們身心當下的那種狀態來細細覺察，而不是盲目地執著于外境、他人。當我們的心越追求外境就會越迷惑、越不安、越痛苦。當我們回到身心當下的這種狀態，嘗試將注意力關注到我們身體緊張的部位，再去把它放松、轉變。

       當我們和他人的產生爭執、矛盾的時候，如果我們想解決這個矛盾，只有在這種情緒比較熱的狀態下才能解決這個矛盾，否則的話，一但負面的情緒控制了我們的語言行為，必然會處于一種失控的狀態。而這個熱的狀態就是回歸我們自己身心的當下，來調整我們身心的狀態，用最直接的方式觀察我們身心緊張的狀態。

       這種方式在打坐的最初也是需要的，你需要把你的身體放松，然后身體坐得正直，身直則心直。因為身直則性直，性直則心直。即你的身體坐正你的氣脈就會通暢，氣脈通暢的話你的心才會有注意力、覺知力，身心、能量身交匯。所以，最基礎的就是身體的放松。像我們知道的中醫調養、瑜伽等，從廣義上來講都是屬于身念處中比較基礎的一些方式。

       只要我們有這種覺知力、佛法的見地，我們可以有這種修行的方法，但是內心又沒有對這種修法的執著，那么你就可以通過這種方法調整自己的身心，好好修行。因為這種最基礎、最簡單的身心不分離修法是比較容易操作、修行比較好入手的方法、方式。在禪修的過程當中，我們的身心會不斷的轉化。找到適合自己的禪修方式。

       第五步的話是回向，做一個圓滿的回向。

       以上，這些就是藥師法門的身心鍛煉法的五個步驟。通過這幾個步驟鍛煉身心。